康熙皇帝登基以后，最大的威胁就是三藩，他们分别是云南平西王吴三桂、广东平南王尚可喜、福建靖南王耿精忠，其中以吴三桂的势力最大。
第一，吴三桂的才能和野心，让康熙害怕
吴三桂是久经沙场的老将，有将帅之才和虎狼的野心。而且吴三桂远在云南，康熙是在明处，吴三桂是在暗处。
第二，吴三桂的军马钱粮储备
京城稻米5分一担，云南要8分一担，吴三桂把民间财富据为己有，并且不向朝廷纳粮，光是粮食就够吴三桂用个30年的。他每年还要从蒙古等地购置兵器、钱粮、马匹。朝廷每年还要给吴三桂6000两银子养兵。兵部记录，吴三桂用兵17万，事实上远远不止这个数目。
第三，吴三桂的真正实力
吴三桂的骄兵悍将，遍布七个省份，他的军队都是久经战场的老兵，他的财富富可敌国。
吴三桂早就有反叛之心，却没有合适的就会，这一点，孝庄皇太后非常清楚，他给康熙的建议是，吴三桂也已经58岁了，养个七八年等他们老死就可以裁撤三藩。
而康熙却一心想要展示自己的宏图大志，三藩不撤，漕运、河工、边患都不能放开手脚去干。