首要，武则天是载初元年，也就是公元690年登上帝位的，而真实独揽大权的时间也是调露二年（680年）今后了；但是，程咬金是在麟德二年，也就是公元665年去世的，享年七十七岁，也算是安享晚年了吧，何来杀于不敢杀直说呢？
从唐高宗李治朝到武则天登基称帝，这段时期内，唐朝是经历过两次大的大臣清理的，第一次是“废王立武”事件，基本清理了以长孙无忌为首的关陇集团，第二次是武则天的“酷吏政治”重点对忠于李唐的达成和李唐宗室的屠杀，本质上来看，这两次事件和程咬金都挨不上，我们具体来看。
这次事件是以李治想废掉王皇后，改立武则天为皇后而发起的。一般情况下呢，一个人依靠某一股势力强大起来，他就比较惧怕这个势力，害怕被这股势力操纵，从小就是小受的李治就是这样，他能够被立为太子，完全是因为以长孙无忌为首的关陇集团的支持。但是李治登基后，关陇集团在朝中的势力极为庞大，但是他自己又不像他爹一样，又强大的驾驭能力，才能平庸，守城之主罢了，但是再弱的皇帝也是皇帝，不愿意老受到长孙无忌的摆布，恨屋及乌，有武则天在后宫兴风作浪，李治也很快厌烦了出身关陇集团的王皇后，打算废后。
关陇集团拥立李治，本身就有强烈的政治投资意图，不仅是投资当下，还要投资未来，你小兔崽子，刚坐稳皇位，就想踢开我们，以长孙无忌为首的势力自然不能答应了，于是就开启了反复的扯淡互怼。皇帝也不是白干的，总是有人愿意做马仔的，以许敬宗为首的一帮大臣就开始支持武则天，但是这还不够，李治又拉来了以徐世绩为首的山东士族的支持，这样李治就放开手脚，大胆的废了王皇后，贬为庶人。同时将反对的丞相褚遂良外贬，四年后，再次将以长孙无忌为首的关陇集团从京师清理出去，完成了第一次大规模清理。
程咬金对皇帝李治的忠诚度，是令李治极为放心的，为什么这么说呢，李世民驾崩后，是程咬金亲自翠微宫奉敕统率飞骑军护卫皇太子李治回朝继位，并在左延明门外连续宿卫三个月，这样才保证了皇权的顺利更替。李治之前，前太子李承乾、魏王李泰、吴王李恪都是有过激烈的权力争斗的，都在朝中有大批的支持者，没有程咬金的保驾护航，李治能不能顺利即位是不好说的，这一点李治心里也是很清楚的，所以对程咬金也是足够信任的。
所以说，在李治生前，不管武则天有没有杀程咬金的想法，他是没有机会杀的，因为李治就不会同意，而李治死后，程咬金都死了快二十年了，想杀也没机会。