背景

万历三十年(1602年)，荷兰建立东印度公司，开始寻找在东方的船舶停靠补给点。

天启二年(1622年)，荷兰舰队七艘军舰外加战士九百人，占领澎湖，并封锁了漳州出海口，明朝海军无法出动。

过程

明朝朝廷下令

明廷下令福建巡抚南居益将荷兰人赶出澎湖。南居益招安当时海上巨寇郑芝龙来对付红毛番，郑芝龙此时因荷兰人以澎湖为基地时，抢夺了悬有郑芝龙令旗的二艘商船，接受明朝福建巡抚的招安，转而攻击荷兰人。

厦门谈判

天启三年(1623年)11月，南居益故意邀请荷兰人前往厦门谈判，在宴会上囚禁荷兰代表团，并乘机袭击烧毁了入侵明朝沿海的荷兰战舰。

战况

天启四年(1624年)2月，福建巡抚南居益亲自乘船到金门，下令明军(总兵力达1万人、兵船2百艘)渡海出击收复澎湖。福建总兵俞咨皋、守备王梦熊，率领兵船至澎湖，登陆白沙岛，与荷军接战。但荷兰军队依仗坚固的工事与战舰顽抗，澎湖久攻不下。『澎湖厅志』记载道：红木埕城要塞「炮楼坚致如铁，巡抚南宫益，遣兵攻之，贼首高文律拒守不下，官军以药轰之，楼倾下海。」

天启四年(1624年)7月，南居益又派出火铳部队支援，明军发动总攻，一直打到风柜仔的红毛城下，然后双方又形成僵持的局面。

天启四年(1624年)8月，明军再次兵分三路，直逼夷城，荷兰人势穷力孤，不得不撤离占领了两年的澎湖。

结果

天启四年(1624年)9月，巡抚南宫益、总兵俞咨皂统率三军与荷军苦战七个月，炸毁红毛城，终於收复澎湖，荷将高文律(Kobenloet)等十二人被补。此一战役，明军共动用兵船二百只，兵力一万人，交战七月，耗军费达十七万七千余两，明军生擒荷军守将高文律，其余荷兰残兵败将仓皇逃往台湾南部。荷将高文律后被被送往北京斩首。澎岛既平，果将高文律等解京，明熹宗并『祭告郊庙，御门受俘，刑高文律等於西市，传首各边，以昭示天下』。

明朝取得了澎湖之战的胜利，成功收复了澎湖。