明郑又称「郑氏时代」，为起始於中国明朝遗臣郑芝龙以太师之位，独揽南明朝政开始的家族政治势力；1653年，郑成功受封延平郡王，建厦门为思明州，宗永历为正朔，并自设知州及六官。
而由中国南明大臣郑芝龙初创、郑成功发扬光大的明郑政权势力，除了支撑南明帝业外，最重要的贡献，为在台湾建立延平王国，并在台湾立下了重要文化经济基础。
初期，明郑不但控制海域，造成「海舶不得郑氏令旗者，不能来往」现象，南明中期(1653年)则自铸永历通宝称王於厦门，後期(1661年)更於台湾建立该岛的第一个汉人政权。郑氏势力自郑芝龙经郑成功到郑经以迄郑克塽，刻划了一个闽南海商集团及政治势力的兴起与崩溃。
中国明朝时期，位居中国东北方的满族，於1599年创作满文字，因受其影响，至此满人发展自我体系的国家，并在1644年趁李自成起事等因素入主中原，定都北京。
因为清朝未立即进取中国南方，加上兵力不足、倡导「以汉治汉」等政策，中国南方各地汉人拥立俱明朝皇帝血统的南明政权。该政权共分别明福王、明唐王、明鲁王及明桂王等南明四王，惟四王并不合作，造成势力分歧。
其中，本被称闽浙「流寇」而被明朝「招抚」的郑芝龙支持南明唐王，并於1644年－1645年间被南明封为平国公、南安伯及南安侯等重要官职并身兼户、兵、工三部尚书。
郑芝龙初建明郑势力後，立即成为海上霸主。明朝郑氏的崛起，虽影响到荷兰人的贸易，让荷兰人数度联合其他势力功击郑芝龙，但郑氏势力仍持续扩张。
其规模史载叙述形容：「凡海舶不得郑氏令旗者，不能来往。每舶例入三千金，岁入千万计，以此富敌国，自筑城安平镇」；「从此海氛颇息，通贩洋货，内客外商，皆用郑氏旗号，无儆无虞，商贾有二十倍之利，芝龙尽以海利交通朝贵，寖以大显」「八闽以郑氏为长城」。
至此，明郑势力的通商范围广及：大泥、浡尼、占城、吕宋、魍港、北港、大员、平户、长崎、孟买、万丹、旧港、巴达维亚、麻六甲、柬埔寨及暹罗，据估计，明郑兵力达20万，拥有超过三千艘船的船队，成为中国东南海洋世界的唯一强权。
1646年，郑芝龙依附中国北方清朝政权，惟其子郑成功仍继续支持南明政权。因两次击退清军有功，郑成功被南明桂王永历帝敕封为延平郡王。至此，郑成功拥有闽浙部分辖土户兵等权，并分别於1658年及1659年两度攻击清政权浙江舟山及南京两重要军事据点，惟均未获得决定性成功。
1661年3月1日，占有金厦两据点的郑成功，为了更多领土，於郑成功嘱意下进攻台湾，最後於翌年阳历2月1日攻下热兰遮城，将荷兰人驱逐出台湾，建立了台湾历史上第一个汉人政权。
1673年，三藩之乱爆发，继承郑成功於台湾建立政府体制的延平王郑经，接受靖南王耿精忠请援，率军由台湾西渡福建。郑经先调遣兵万人、船百馀艘先行至厦门，耿军派人往接。
开始时，郑军军容不似郑成功时代之壮盛，耿精忠一开始甚为轻视。但郑经以厦门为根据地，陆续攻下漳州、泉州与潮州三府，进而攻下闽粤交接的重要据点惠州。郑经於攻下多座城市，商请耿精忠如约拨船及地方安插兵士。耿精忠不答，双方开始交恶。
1680年代始，广东平南王尚之信、福建靖南王耿精忠相继为清军所平定，云南平西王吴三桂亦死亡，明郑势力败退仅能守住厦门。
1680年，清将万正色遣人游说郑军水师副总督朱天贵（原为耿精忠部将）率舰300艘，将士2万馀人降清，郑经放弃厦门并率残馀兵力回台，至此，明郑在中国闽南的势力再度消失。
惟因清朝军事攻击等因素，明郑政权於1683年随延平王国降清而灭亡。1683年郑氏王朝覆灭後，郑家军将领与军队悉数被强迫内渡中国，而据《钦命太保建平侯郑造报官员兵民船只总册》，最後防守台湾的明郑官兵共有37500名。