正蓝旗是清代八旗之一。明万历二十九年（1601年），努尔哈赤整顿编制，分别以牛录额真、甲喇额真、固山额真为首领，初置黄、白、红、蓝4色旗，编成四旗。正蓝旗建于此时，因旗色纯蓝而得名。
正蓝旗在顺治前与正黄、镶黄列为上三旗，顺治初，被多尔衮送给多铎多铎成为正蓝旗旗主一年后去世，由多铎嫡子多尼继承为正蓝旗旗主。
1626年，皇太极继承汗位之后，为名正言顺及巩固权力，将多铎、阿济格二人统领的正黄、镶黄二旗改色为正白旗与镶白旗，而将自己亲领的原正白旗改色为正黄旗，又夺取杜度的原镶白旗主之位，交由长子豪格担任，改色为镶黄旗。
1635年，正蓝旗主莽古尔泰意图谋反事败遭诛，该旗由皇太极所得，皇太极将其与自己亲领的正黄旗混编重组，成为新的正黄旗和镶黄旗，并从中分出8个牛录给予豪格统领的原镶黄旗，又再次将其改色为正蓝旗。
1648年，豪格因1643年的继位之争被摄政王多尔衮陷害下狱暴亡，正蓝旗又为多尔衮所得，多尔衮将其与自己统领的正白旗混编重组，成为新的正白旗和镶白旗，将胞弟多铎统领的原镶白旗改色为正蓝旗。此后八旗旗色再未变化。
莽古尔泰
爱新觉罗·莽古尔泰（1587年－1633年），清太祖努尔哈赤的第五子，母为继妃富察·衮代，领正蓝旗。莽古尔泰和代善、阿敏、皇太极并称清初四大贝勒。
少时跟随努尔哈赤征伐乌拉部，英勇善战，连克六城。天命元年（1616年）四月，受封为和硕贝勒。天命四年（1619年），参加了萨尔浒大战，先随努尔哈赤在萨尔浒全歼明总兵杜松所率的六万之军，又南下歼灭刘綎部四万余众。天命五年（1620年）受命追袭明军，直至浑河。天命十一年（1626年）攻击喀尔喀巴林部，独自率兵渡河，斩俘甚众。太宗即位后，数次进攻明军，屡立战功。
天聪六年末（1633年1月11日）莽古尔泰逝世。死后被揭发有谋上之罪，被追夺其封爵。
主要成就
莽古尔泰的军事成就是在努尔哈赤时期开始的。明万历四十年（1612年）的时候莽古尔泰就跟随努尔哈赤征伐乌拉，英勇善战，沉重打击了海西女真的乌拉部。天命四年（1619年），莽古尔泰参加了努尔哈赤大败明军的萨尔浒战役，莽古尔泰跟从努尔哈赤伏兵于萨尔浒谷口，在萨尔浒大破明军，击毙明军将领杜松。又跟从努尔哈赤回军击斩刘綎。
同年跟从八旗讨伐扈伦四部的最后一部——叶赫。天命五年（1620年），努尔哈赤进攻明朝的懿路、蒲城两个城池，莽古尔泰率健锐百人追击明兵至浑河。并且率兵救援被察哈尔部林丹汗攻打的科尔沁部取得胜利，林丹汗败逃。天命十一年（1626年），在努尔哈赤讨伐喀尔喀巴林部的时候，莽古尔泰独自领兵在夜间渡河攻击并且俘获无数。
清太宗皇太极即位后，莽古尔泰数次进攻明军，屡立战功。天聪元年（1627年），他率兵攻击明军右屯卫。天聪三年（1629年），跟从大军伐明，偕同多尔衮、多铎为接应，逼降汉儿庄，莽古尔泰自汉儿庄整合军队击败明总兵赵率教。天聪四年（1630年）二月，攻克永平、遵化。天聪五年（1631年），跟从大军围攻大凌河，莽古尔泰跟从皇太极攻击明军，俘虏张春等。天聪六年（1632年），跟从大军伐察哈尔，林丹汗逃遁。