清朝一定要消灭准噶尔汗国缘于准噶尔是不是天生就是大清的敌人，这个问题本身就带有历史性争论的话题。准噶尔汗国在当时是代表西蒙古一方，他是置于清朝之外的汗国，严格的说他的兴起和壮大不受清朝节制，毕竟山高皇帝远，哪能管得了这么多，所以才造成准噶尔汗国不停挑衅大清，才遭灭亡，这也是为何清朝一定要灭准噶尔汗国原因。
早在清朝兴起的时候，还是东北一方政权，那时皇太极还被明朝阻隔在关外，为了一心对付明朝，提出了满蒙一家，毕竟当时他打败了黄金家族最后大汗林丹汗，夺得了蒙古帝国世传玉玺，所以全蒙古尊奉大清皇帝为蒙古大汗，为此皇太极给自己起了天聪汗。从那时起，漠南漠北基本就承认他为共主，漠北虽然当时没有臣服可表面上会做文章，原因他也是达延汗的一份子，清朝皇帝的目标和他们一样，所以形式上臣服了。至于漠西，就是所谓伊犁地区，其中也包括准噶尔，他们也同样上表臣服，所以准噶尔汗国一直被示为大清的臣子，臣子叛乱，主子教训是自然之理，不论如何也不可能被冠以他与他国之间。
清朝就因为准噶尔汗国才对西北地区大动干戈的，准噶尔汗国在葛尔丹一朝势力坐大，雄居西北，从伊犁地区一向向四周辐射，控制了新疆大部分地区，又挥师哈萨克汗国，基本算搞定了。现在他又和北部沙俄接壤，也是阻碍沙俄帝国南下的强大力量，可是准噶尔汗国没有想到这一点，而是想试图利用沙俄对付大清，毕竟那时的大清已经打败了明朝，拥有中原，实力不容忽视，所以他才拉出沙俄。沙俄帝国和清朝不相上下，那时也出了一个伟大帝王叫彼得大帝，善于学习欧洲的先进东西，来武装沙俄，彼得大帝可以说和康熙帝一样，是个雄心勃勃的帝王。可惜沙俄却有点怕清朝，原因是雅克萨之战，沙俄意图没有得逞，被大清在黑龙江打得落花流水，又签订了《尼布楚条约》，由于模糊的勘界已经让沙俄达到了满意的程度，那时沙俄被拒在外兴安岭以北，他们最喜欢不毛之地，所以一直盘踞在西伯利亚地区。
就因为此，噶尔丹意图失效了，沙俄只是暗中支持，却不敢正面来，噶尔丹仗着沙俄先进武器开始东征大清，他当场撕掉了康熙帝的劝降信，从漠北入手，穿过外蒙古广袤平坦的地形进入大清北疆，可在乌兰布通，他们进军停止了。康熙帝他哪能惹得起，从内地调的二十万大军就将他平定了，一直追到外蒙的莫昭多，噶尔丹可以说是一路丢盔弃甲，后方又起火了他的侄子策妄阿拉坦布夺取准噶尔汗国权利，试图将噶尔丹大军扼杀于外，噶尔丹势单力薄没办法选择自杀，清朝一闻噶尔丹一死那时还好收兵了。
可是没过多久，准噶尔汗国又起哄，想蚕食周围各部，西藏，青海地区都被他牵扯进去，他们主要目标就是对付大清，试图从西域反扑过来，可他们失算了，惹了清朝，最终吃掉的是自己，由于不断的挑衅，才导致后来到乾隆帝时不得不做出彻底铲除后患的原因。所以清朝在当时也不想把准噶尔汗国当做敌人，只是受对方的压力所致，才做出一定消灭准噶尔汗国原因。