李渊的皇后是京兆平陵人窦氏。父亲窦毅在后周任上柱国，母亲是周武帝的姐姐襄阳长公主。入隋以后，窦毅为定州总管、神武公。窦氏出生的时候，史称发垂过颈，三岁时头发便与身等。窦氏渐渐长大，读书识字，爱读《女诫》、《列女传》等，过目不忘，周武帝很疼爱窦氏，将她养在后宫，宠爱过于其他外甥。
窦氏很敏锐，常有过人的见地，还极重亲情。史载说：“时突厥女为后，无宠，后密谏曰：吾国未靖，虏且强，愿抑情抚接，以取合从，则江南、关东不吾梗。武帝嘉纳。及崩，哀毁同所生。闻隋高祖受禅，自投床下，曰：恨我非男子，不能救舅家祸！毅遽掩其口，曰毋妄言，赤吾族！”窦氏如此义形于色，如此痛恨朝代更迭，后来如何又做了李渊的皇后？隋帝受禅即位，大局已定，群雄一一剪灭，四海臣服。
在这种情形下，窦氏一个窈窕弱女又能如何？窦氏又到了出阁的年龄，求婚者络绎不绝，窦毅便说：“此女有奇相，见识不凡，何可妄与人？”遂在屏风间画两只孔雀，让求婚者每人射两箭，射中孔雀眼睛的方可成婚。求婚者被一一淘汰，达数十人之多，最后轮到唐高祖李渊，两箭竟各中一目！于是，英雄配美人，窦氏便自认是命，甘心嫁给了李渊。
当时，元贞太后羸老有疾，但却天性严厉，诸姒娣都很敬畏，没人敢去侍疾。窦氏侍奉太后，独谨慎尽孝，时或盈月不释衣履。窦氏做得尽善尽美，宫中上下人等无不钦佩。窦氏还工于篇章规诫，文有雅体，还善于书法，模仿李渊的字迹几可乱真，人不能辨别。窦氏的政治见识在嫁给李渊以后，又得验证和发挥。
当时，李渊在炀帝手下，爱畜善马。窦氏见到以后，便对李渊说：“上性乐此，盍以献？徒留之速罪，无益也。”李渊不听。不久，李渊果然坐谴。“帝（李渊）后见隋政乱，多妄诛殛，乃为安计，数奏鹰犬异驹。炀帝果喜，擢位将军。”李渊经历这些以后，便流着泪对诸子说：“早用而毋言，得此久矣！”窦氏替李渊生有四个儿子：长子建成，次子世民，三子元霸，四子无吉。
窦氏生前没有封为皇后，因为李渊还一直在炀帝的手下。大业年间，她便撒手尘世，死于涿郡，年仅四十五岁。李渊燔得有天下以后，诏窦氏所葬的园地为寿安陵，谥穆。后袝献陵，尊为太穆皇后。窦氏在生下的四个儿子中，最宠爱的是次子李世民。
李世民生下就有二龙之符，呼称“后于诸子中爱视最笃”。二龙之符的帝象也许是史臣的牵强，但窦氏对李世民爱视最笃恐怕符合事实。因为，李世民玄武门兵变，杀死长兄建成和四弟元吉以后，逼父皇李渊禅位，做了大唐的第二任皇帝。
有一次，李世民路过庆善宫，睹物思人，想起了母亲窦氏，便“览观梗欷，顾侍臣曰：腾生于此，今母后永违，育我之德不可报！因号恸，左右皆流涕”。李世民乃享后于正殿。又一日，李世民幸九成宫，梦中看见了母亲，和活着时一样。梦醒以后，李世民潸然泪下。第二天，李世民诏有司大发仓粮，赈济贫瘠，以报窦氏之德。上元中，谥窦氏太穆神皇后。由此可见他们母子情深。