1917年7月2日，广东省长朱庆澜邀请孙中山组织军政府，驻粤滇军将领张开儒也主张迁都广州，认为“国都既陷，政无所出。维今大计，速迁政府，设置地点，广州为宜。组织内阁，遥戴黎公”。
7月6日，孙率海琛、应瑞舰离沪赴粤，章太炎、朱执信、廖仲恺、陈炯明等同行。17日到达虎门，旋改乘江固舰抵黄埔，广东督军陈炳锟、省长朱庆澜等前往江边迎接。
孙中山在广州与南下的海军官兵合影留念
孙中山在黄埔公园欢迎会上发表演说，主张请海军全体舰队来粤，然后在粤召集国会及请黎元洪前来执行大总统职务。
19日，孙中山抵广州，请国会议员来粤召集国会以决定大计。朱庆澜表示赞成。陈炳锟以“南方力薄，经济困难”为辞推托。孙中山逐一解释，并希敦促陆荣廷东下合作，陈勉强同意。同日，孙中山通过津、沪各报邀请国会议员南下护法，召开国会，以行“民国统治之权”。
21日，程壁光与第一舰队司令林葆怪率舰队自吴淞口开往广东，唐绍仪、汪精卫等同行。行前在沪发表《海军护法宣言》，宣布海军讨逆三大目标：“一曰拥护约法；二曰拥护国会；三曰惩办祸首。”表示“必使已毁之约法，回其效力；已散之国会，复其原诽谤。元恶大憝、为国蟊贼者，无所逃罪，然后解甲。自约法失效、国会解散之日起，一切命令皆无根据，当然认为无效。发此命令之政府，当然否认”