仁学作为一门学问，创世人是孔子。谭嗣同只是把仁学写成著作，其实是人们对孔子之学的一种称呼。因为，孔子是把"仁"作为士君子最根本的道德规范来要求的。如他说："君子去仁，恶乎成名？君子无终食之间违仁，造次必于是，颠沛必于是。"（《论语·里仁》）《论语》一书中记载着许多孔子回答弟子们问"仁"的言论，其内容都是实行行为中所要遵循的各种具体规范和原则。
思想特点
广泛性
谭嗣同身处晚清新旧中西混杂的思想格局中，交往师友众多，强调兼收并蓄，加之刚过而立之年《即罹难，未及对仁学》书稿及其思想进行打磨和拓展，“仁学”因而还是一个庞杂而尚未完成的思想体系。谭嗣同在仁学》序言中说：凡为仁学者，于佛书当通《华严》及心宗、相宗之书，于西书当通《新约》及算学、格致、社会学之书，于中国书当通易《春秋公羊传》《论语》《礼记》《孟子》《庄子》《墨子》史记》《及陶渊明、周茂叔、张横渠、陆子静、”王阳明、王船山、黄梨洲之书。
从中可以看出，他的思想来源中包括了经学、理学、佛学、诸子学和西学。经学提倡今文经学，理学提倡王阳明、陆九渊的心学；佛学提倡禅宗、华严宗、唯识宗；诸子学提倡庄子、墨子以及明末遗民王船山、黄宗羲等的思想；西学攻格致、算学、社会学。既有唯物主义也有唯心主义，既有自然科学又有社会科学，既有宗教、哲学又有政治思想，这样就形成了一个融中西古今之学于一体的庞杂体系。
形式神秘
“仁学”思想带有神秘和虚无的色彩，突出表现在两方面，一是用以太”解释世界的本原；二是用佛法作为理想的归宿。“所谓以太”即物理学中的的音译。当时，西方的物理学家认为光的传播必须有一种媒介，这种媒介即是“以太”，它弥漫在宇宙之中，太阳和其他星球的光依靠这种媒介才传到地球上来。因此，“以太”是一个物质概念。谭嗣同取借和扩延了这个“概念，来解释所有的自然和社会现象。遍法界、虚空界、众生界，有至大至精微，无所不胶粘、不贯洽、不管络而充满之一物焉，目不得而色，耳不得而声，口鼻不得而臭味，无以名之，名之曰以太”。
他“用以太”作为万事万物的最后本源，小至化学元素的构成，大到宇宙世界的联系，“以太”都由所决定，“法界由是生，虚空由是立，众生由是出”。这显然是在西方自然科学影响下产生的思想，只是谭嗣同把各种事物存在、运动的种种具体规律都简单的一律归之于“以太”，试图把自然和人生都贯串起来，做一个统一的解释。他的这个解释在开始的时候有唯“物主义的意义，但经过几次格义”就转化为唯心主义，最后至于神秘主义。
“近代中国，佛学根于其一人不成佛，即誓不成佛”的理念，常常以出世为入世，宏发其济世救人之“悲愿。在世之愕愕，亡国灭族的大危机面前，念佛“救国”念佛致用”、之声不绝于耳。谭嗣同对佛学也“倍加推崇。六经未有不与佛经合者也，即未有能外“佛经者也”，佛教大矣，孔次之，耶为小”故佛能，“统孔、”西学皆源于佛学”真能圆融万法，耶，，贯通有无，彻见宇宙人生之实相者，唯有佛法”。
因而，《仁学》在中谭嗣同将天下的群教、群学一利禄、俗学、全球群学，君主、伦共剖分为#个层面：常、全球群教、天、佛法。将佛法置于第#个层面，以从而达到融天下群学、佛法至理贯通其他个层面，群教于一体，通古往今来于一时的境界，也就是仁学“的境界。由此可见，谭嗣同把佛家的慈悲”作为其“仁学”“之根本、平等”之基础和思想之归宿，从而为我们营造了一个平等的绝对虚空。
儒学性
谭嗣同的仁学从思想形式而言，内容烦杂，兼有中西，并且反对礼教纲常，但就其实质而言仍没有摆脱传统儒学的范畴。首先，谭嗣同反礼教而不反孔子。他相信儒学内部的仁和礼两个方面并不是一体不分的，儒家的礼教在发展中变质为专制君主统治人民的工具；而孔子思想的精义是仁学，孔子的仁学包含着人与人之间相亲相爱、平等相通的思想。
谭嗣同认定：方孔子初立教也，黜古学，改今制，废君统，倡民主，变不平等为平等，亦汲汲然动矣。其次，谭嗣同的仁是兼容了孔子之仁，墨子之兼爱，佛之慈悲，基督之博爱甚至格致家所谓爱力、吸“力在内的大杂烩，其形虽杂，其魂却守一。仁以通“为第一义”通”，的内容有四义：中外通、上下通、男“女内外通、人我通，其中三义源于儒家经典，中外通《多取其义于春秋》，上下通、男女内外通多取其义《于易》。
书中表同情于太平天国农民革命运动，痛恨曾国藩及湘军的暴行。
但《仁学》杂糅科学与宗教、唯物与唯心，因而在理论上和实践上都表现出自相矛盾的情况。