雍正皇帝刚登基的时候，对隆科多非常信任。许多事情上，雍正皇帝都咨询隆科多的意见，一派君臣和睦相协、同舟共济的景象。
但是，年大将军和雍正皇帝藩邸旧人，是很瞧不上隆科多的，认为“舅舅”只不过是一个极其普通的人而已。但雍正皇帝出于稳固自身统治的考虑，不愿自己的左膀右臂闹僵，竭力表明隆科多对年羹尧的尊重，说舅舅隆科多说有些事必须要等你进京一起商量（年羹尧在西北），又表示自己以前也不知道隆科多的才能，后来才明白自己大错，隆科多真正是父亲康熙皇帝的忠臣、朕的功臣和国家的良臣，真正是“当代第一超群拔类之希有大臣”。
下面的一段文字，就是雍正皇帝的原话：
“舅舅隆科多，此人朕与尔先前不但不深知他，真正大错了！此人真圣祖皇帝忠臣、朕之功臣、国家良臣，真正当代第一超群拔类之希（稀）有大臣也！”
接着，雍正皇帝便自作主张，把年羹尧的长子过继给隆科多为子——尽管年羹尧本身就比隆科多小了一辈，以此来撮合两人为自己效命。隆科多本来就对年羹尧无恶意，又经过这样的攀亲，他能不跟年羹尧交结吗？电视连续剧《雍正王朝》中把这段内容描写得相当成功：
隆科多：“年大将军能够把长子年熙过继给我隆家，这让隆某深感荣幸。隆某虽然现在已有两个儿子，但是始终不能如愿。因为早有仙人指点我，说我命中该有三子。今天能得到皇上的恩赐，就如同得到上天的赏赐一样。皇上，隆某已经把年熙改名为德柱，隆德柱。并且已经在宗人府造册入典了。隆某在此叩恩谢皇上。年大将军，以前多有得罪。看在咱们儿子的份儿上，就请年大将军多多见谅。”
年羹尧：“哪里哪里，今后咱们就是一家人，一家人就不说两家话。”
但是，到1725年下半年，雍正皇帝便对隆科多有所责难，并开始有步骤地打击隆科多了。
为什么在短短两年时间内，雍正皇帝对隆科多的态度就转了一个大弯呢？
主要原因在于隆科多在以下两个方面对皇权产生了不利的影响：
第一，居功自傲
比如，隆科多经常把自己比成诸葛亮，奏称“白帝城受命之日，即是死期已至之时”一语，又称康熙皇帝死日他曾身带匕首以防不测。这虽是在他快倒台的时候说的，但难保在平日不会有此类话语流露。
还有，隆科多曾自夸九门提督（步军统领）权力很大，一声令下就可以聚集两万兵马。这些话语多少暴露了隆科多拥立雍正皇帝的真相，自然为雍正皇帝所忌讳。
实际上，当日畅春园的气氛必然是非常紧张的，步军统领所统辖的兵力也确实约有两万名官兵，而隆科多说他带匕首防身也情有可原。但这些话语后来却都成了隆科多的罪状。
在罪状中，雍正皇帝认为，康熙皇帝去世当日隆科多并不在康熙皇帝身边，也没有派出近侍之人，隆科多此时重提这些话就是大不敬，就是欺罔，全然没有顾及此前不久他还因为隆科多的拥戴之功而感恩戴德。
臣子有功，主上高兴的话可以恩赏，但不允许你自己表功，不然那就是要挟，就是说明主上无能或者无德，这就是大清皇帝雍正的逻辑。
第二，擅权结党
隆科多同年羹尧一样，都对其他官员的任命予以干涉，称“佟选”和“年选”。虽然隆科多是正常的途径，他任吏部尚书，但选官这种事情一向是皇权所为，你一个臣子居然选起官来了，不仅是擅权，而且有结党之罪。
隆科多对雍正皇帝的疑忌不是不知，他也想自留退路，于1725年年底主动提出辞去步军统领一职。这一招正中雍正皇帝下怀，他早就不想把这个要职留在隆科多手里，而且准备让与隆科多不甚亲密的巩泰来接手这个职位。以准许隆科多辞去步军统领一职为契机，雍正皇帝开始公开打击隆科多。
说到结党，电视连续剧《雍正王朝》里面表现的是隆科多在雍正皇帝继位之后，好几件关键的事情上他就表错了态，逐渐失去了宠信，于是隆科多就和八爷允禩越走越近了，最后还参与了八爷的逼宫事件。