在清代地方“省、府、县”三级行政系统的设置中，县作为基层行政单位，乃系皇权向基层民众延伸的最直接、最有效媒介。所谓“天下之治始于县”，知县作为县级政权最高行政长官，更是被雍正皇帝称为“亲民之官，吏治之始基”的重要官职。
县衙，作为县级政权的核心，在知县的领导下，“掌一县治理，决讼断辟，劝农赈贫，讨猾除奸，兴养立教”，并对一县教育、礼法、祭祀乃至养老事宜，“靡所不综”。相对于封建王朝的最高统治机构——朝廷而言，县衙于一县之中几同朝廷，而知县在一县之中的巨大权限，甚至如帝王一般存在。
那么，清代知县领导之下的县衙，到底拥有多少官吏、多少职能机构，才能完成对县级政权的治理呢？
《清史稿·职官志》明确记载：“县知县一人，正七品”，相比较于现今的公务员级别划分，基本等同于县处级正职，相当于一县之长。只不过，清代的知县较之现如今的县长，职权范围更大、手中权力更大。就知县的具体职权来看，知县几乎兼任一县所有职能机构的一把手，对一县之内几乎所有工作都拥有绝对领导权、决策权。甚至在执掌一县政务的同时，知县还担负相当部分军务职能，剿匪平叛、筹集军资，可谓无所不能、无所不掌。
清代朝廷对于知县官职人选的选择，也经过了数次更改并逐步发展完善。顺治朝，“依明往例，行取知县”；康熙朝，“命督、抚举贤能”；乃至咸丰朝的“优胜劣汰，顾其时杂流竞进”直到清末时期，依据捐纳、军功、垦荒、荒政等综合考量标准进行知县官职人选的选拔和任免。
知县三佐贰官
根据相关史料记载，清代知县一下一般设置佐贰官：县丞、主薄、典史。《清史稿·职官志》记载：
县丞、主簿，分掌粮马、征税、户籍、缉捕诸职。典史掌稽检狱囚。（无丞、簿，兼领其事）
具体细分下来，县丞主管一县文书档案、仓库、粮马、征税等，品秩为正八品，基本相当于现今的乡科级正职级别；在县丞之下，设置攒典一人，协作办公。主薄主管一县户籍、缉捕、文书办理事务，品秩为正九品，基本相当于现今的股所级正职级别；在主薄之下，同样设置攒典一人，协作办公。典史基本相当于现今的县公安局长、县看守所所长的合并，只是行政级别属于未入流。而且，如果县衙不设置县丞、主薄，典史还会肩负两者职能，成为知县的唯一佐贰官。
知县十大属官
除了佐贰官，知县之下一般还设置十大属官：巡检、驿丞、库大使、仓大使、税课司大使、徬官、河泊所大使、训科、训术、僧会。
按照《清史稿·职官志》中的职能记载，巡检一人，追捕盗贼，查办违法乱纪之事，品秩从九品；驿丞一人，县驿站领导，未入流；库大使一人，县衙仓库主管，根据仓库等级不同而品秩不同；仓大使一人，县级粮库主管，未入流；税课司大使一人，执掌赋税征剿，未入流；徬官一人，执掌一县水利闸门之蓄水和放水，未入流；河泊所大使一人，掌管渔业赋税，未入流；医学府正科训科一人，县医院院长，未入流；阴阳学府训术一人，掌占卜，未入流；僧纲司僧会一人，掌宗教事宜，未入流。
就知县一下的属官种类和职权范围来看，几乎囊括了一县所有庶务。除军务外，在知县统领、佐贰官辅佐、属官具体负责的县衙中，俨然一个微型朝廷。
三班六房
除了佐贰官和属官以外，县衙下辖日常办公之三班六房：吏、户、礼、兵、刑、工六房；皂、壮、快三班。
六房，对应朝廷六部，乃系县衙的直属组织机构，“附于州县公堂之左右”。县衙六房，设置书吏一名，并可根据具体情况，自行招募助手协助办公。书吏，可有上级政府委派，也可由知县自行招募。
三班，分为负责县太爷升堂审案时的站班、行刑等事的皂班，也就是影视剧中常见，高喊“威武”，负责打板子的两排衙役；负责力差、催科、征比等工作的壮班，基本类似于现今税务部门的执法人员；负责缉奸捕盗、破案、解囚、捉拿犯人等工作的快班，也就是我们常说的捕快。
清代县衙，在知县的领导下，机构设置复杂、系统；官员配给众多、全面，相较于治理国家的朝廷而言，丝毫不差。知县，作为县级政权的最高行政长官，主抓全面、领导一切，权力巨大。